Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 EIF4A1P10-201ENST00000428832 1216 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 TSPAN8-203ENST00000546561 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC087286.4-201ENST00000558757 746 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AL157359.3-201ENST00000623771 217 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 KRIT1-204ENST00000394507 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 KCNK2-201ENST00000391894 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AL591848.3-201ENST00000570141 2968 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CA8-201ENST00000317995 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RN7SKP139-201ENST00000410411 293 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 PROX1-AS1-203ENST00000451396 476 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC108471.2-205ENST00000529314 628 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CAV1-201ENST00000341049 2704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ETV3-202ENST00000368192 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ADAMTS12-203ENST00000504830 8774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AOAH-208ENST00000612871 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CASP7-207ENST00000452490 2271 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 LINC01139-201ENST00000400946 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 TTC23-203ENST00000394132 3849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AP000350.7-201ENST00000624923 8030 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL365475.1-201ENST00000565135 1949 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 COL4A6-203ENST00000394872 6750 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 GC-208ENST00000513476 1567 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RCAN1-210ENST00000487990 2520 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ACTR3C-206ENST00000613959 5142 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TMEM144-201ENST00000296529 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms