Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC008991.1-201ENST00000591285 537 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC005176.1-203ENST00000597077 532 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC103691.1-201ENST00000619654 520 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LINC01002-216ENST00000632351 572 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 OR8G3P-203ENST00000641848 1344 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 CAP2-203ENST00000465994 1404 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC096664.1-201ENST00000393996 778 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AL772337.2-201ENST00000411992 981 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC104455.1-201ENST00000417340 736 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC004129.1-201ENST00000417617 796 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 RPL21P88-201ENST00000436649 436 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LSMEM1-202ENST00000439068 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC092568.1-201ENST00000440950 1284 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC118653.1-201ENST00000442627 561 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 OR7E109P-201ENST00000445529 855 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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PDK4Q16654 RPL17P37-201ENST00000490729 548 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 PPM1K-204ENST00000508256 923 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PDK4Q16654 NACA2-201ENST00000521764 777 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AP005229.1-201ENST00000592198 810 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PDK4Q16654 DMKN-268ENST00000602781 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PDK4Q16654 AL034428.1-202ENST00000613736 625 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AP001442.1-201ENST00000617755 659 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AL031772.1-216ENST00000619494 697 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PDK4Q16654 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AP001442.1-206ENST00000600590 1573 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 MGC27382-202ENST00000436742 1993 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LINC00662-203ENST00000586954 2254 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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