Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP16Q9Y5T5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms