Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TPRKBQ9Y3C4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms