Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA2Q9UJY4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA2Q9UJY4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA2Q9UJY4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA2Q9UJY4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms