Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DNAJC27Q9NZQ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC27Q9NZQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms