Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS2Q9NYR9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms