Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms