Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD3Q9NX63 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms