Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms