Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMILIN3Q9NT22 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms