Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms