Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms