Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms