Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF408Q9H9D4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF408Q9H9D4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF408Q9H9D4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF408Q9H9D4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF408Q9H9D4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF408Q9H9D4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF408Q9H9D4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms