Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM7Q9C029 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms