Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG101Q9BSB4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms