Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC39A3Q9BRY0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms