Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms