Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCA3Q99758 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCA3Q99758 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCA3Q99758 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCA3Q99758 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms