Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms