Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms