Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms