Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMNQ96JQ2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMNQ96JQ2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms