Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms