Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX58Q96C10 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms