Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRG4Q92954 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms