Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms