Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms