Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms