Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NGDNQ8NEJ9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms