Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC21AQ8NDW8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
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