Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms