Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms