Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms