Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms