Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms