Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER4Q7RTX7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms