Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms