Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD7BQ6GQQ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms