Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF123Q5XPI4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms