Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GKAP1Q5VSY0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms