Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFYVE27Q5T4F4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms