Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms