Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms