Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP55Q53EZ4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms