Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms