Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF1Q3BBV0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms