Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms