Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB5Q2M3G0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB5Q2M3G0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB5Q2M3G0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB5Q2M3G0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB5Q2M3G0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms